Mejora genética. Genómica y nuevas tecnologías
Author(s):
Luis Varona Aguado
Updated:
JAN 15, 2022
Languages:
Read
Selección genómica (I)
A partir del conocimiento de la secuencia del genoma de las especies domésticas y del porcino en particular (Groenen et al.., 2012), se ha desarrollado una nueva técnica de valoración genética de reproductores denominada selección genómica, que se ha implantado en prácticamente todas las empresas de mejora genética porcina. La selección genómica utiliza un panel muy grande de marcadores SNP (single nucleotide polymorphism) que se genotipan utilizando un chip comercial de ADN.
Inicialmente, la selección genómica se describió como un procedimiento en dos etapas (Meuwissen et al., 2001). En una primera fase se utilizaba un grupo suficientemente grande de animales genotipados y fenotipados para definir una función predictiva que posteriormente se puede aplicar a animales solo genotipados de la misma población. En la figura 1 puede verse un esquema de este planteamiento.
Figura 1. Esquema de la implementación de la selección genómica en dos etapas. 1: determinación de las ecuaciones de predicción y 2: utilización de dichas ecuaciones con “solo” la información genotípica.
Selección genómica (II)
Sin embargo, en porcino, el procedimiento más utilizado es el denominado GBLUP (VanRaden, 2008), que es similar al BLUP, pero que sustituye las relaciones de parentesco genealógico entre los animales por el denominado parentesco genómico. Los dos parentescos pretenden medir el porcentaje de genes que comparten por descendencia dos individuos, pero la información para esta medición es distinta: el parentesco genómico se calcula a partir de los marcadores SNP y puede combinarse con el parentesco genealógico entre los animales no genotipados (Legarra et al., 2014). Las figuras 2 y 3 ilustran las diferencias entre el parentesco genealógico y el genómico.
Figura 2. Parentesco genealógico. Familia de padre (A), madre (B) y 3 hermanos completos (C, D y E) con una dotación genética simplificada (3 cromosomas y sin recombinación). El parentesco entre padres e hijos es de 0,5 porque los hijos siempre heredan la mitad de los genes de cada padre. El parentesco entre hermanos completos también es de 0,5, porque de media y sin tener más información, los hermanos comparten la mitad de los genes de cada progenitor.
Figura 3. Parentesco genealógico de la misma familia que en la figura 2. La dotación genética se muestra en colores vivos porque es la información empleada para la construcción de la matriz, mientras que los las relaciones familiares se difuminan. Los parentescos entre padres e hijos siempre son 0.5, tanto el genómico como el genealógico. Sin embargo, entre hermanos hay importantes diferencias. El parentesco genealógico entre hermanos completos siempre es 0,5 porque se carece de información específica, mientras que el parentesco genómico es más preciso y puede variar. En el ejemplo, oscila entre 0 (individuos C y E) y 0,66 (individuos C y D).
[...]
About
Copyright Statement
© All text and images in this publication are copyright protected and cannot be reproduced or copied in any way.Subscribe
Suis es un programa de formación para técnicos de porcino diseñado por los más cualificados especialistas. Su objetivo es garantizar la completa y permanente actualización profesional que hoy en día necesitan los profesionales del sector.
A través de este programa cada técnico realiza cursos para mejorar su formación en aspectos claves de la profesión, tiene acceso a los últimos trabajos e investigaciones en materia de sanidad animal, nutrición, genética, manejo o de cualquier otra disciplina, y conoce desde las técnicas clínicas y de manejo más novedosas hasta las principales noticias del sector porcino.
Comments (0)
Ask the author
0 comments